Biological and water quality monitoring of native fish sanctuaries in the lower Colorado River basin

Authors: Carpenter, Jeanette, Mueller, Gordon A., Thullen, Joan S.

Year: 2007 (xxxix)

Abstract

The conservation plan for native fishes of the lower Colorado River (Minckley et. al., 2003: Bioscience 53:219-234) recommended development of isolated, secure, off-channel habitats to be used in the recovery of native fish populations. We designed a monitoring plan to evaluate conditions of current or potential sanctuaries for razorback sucker, Xyrauchen texanus , and bonytail, Gila elegans . The objective of our monitoring protocol is to provide in formation to managers that will enhance success of established and future native fish sanctuaries. We collected baseline data at eight sites. Physiochemical parameters included bathymetric mapping, chlorophyll, nutrients, temperature, pH, dissolved oxygen, conductivity, major ions, and heavy metals. Biological data included: abundance and community composition of zooplankton; population structure, condition, and reproductive success of native fishes; possible presence of nonnative fishes; and

mapping and identification of submerged vegetation. As of July 2007, six sites have razorback sucker, bonytail or both: Cibola High Levee Pond, Davis Cove, Mohave Community College Pond, Office Cove, Parker Dam Pond, and Three Fingers Lake. Two of these sites (Cibola High Levee Pond and Three Fingers Lake) are compromised by presence of nonnative fishes. We recently documented successful spawning and recruitment at Davis Cove and Parker Dam Pond. The range of physiochemical and biological parameters varied considerably among sites that support growing or stable populations of native fishes.

Resumen

Monitoreo biológico y de la calidad del agua en santuarios para peces nativos en la cuenca baja del Río Colorado El plan de conservación para peces nativos de la cuenca baja del Río Colorado (Minckley et. al., 2003: Bioscience 53:219-234) recomendó el desarrollo de hábitats aislados, seguros y fuera del canal principal del río para ser utilizados en la recuperación de poblaciones de peces nativos. Nosotros elaboramos un plan de monitoreo para evaluar las condiciones de los santuarios actuales o potenciales para el matalote jorobado, Xyrauchen texanus, y carpa elegante, Gila elegans. El objetivo de nuestro protocolo de monitoreo es proveer información a los administradores que incrementarán el éx ito de santuarios para peces nativos, futuros o ya establecidos. Se colectaron datos básicos en ocho loca lidades. Parámetros fisicoquímicos incluyeron: Mapeo batimétrico, clorofila, nutrientes, temperatura, pH, oxígeno disuelto, conductividad, iones principales y metales pesados. Los datos biológicos incluyeron: Composición de comunidad y abundancia de zooplancton; estructura poblacional, condición y éxito reproductivo de peces nativos; posible presencia de peces no-nativos; y mapeo e identificación de la vegetación sumergida. Hasta julio de 2007, seis loca lidades contienen matalote jorobado y/o carpa elegante o ambos: Estanque del bordo alto de Cibola, Davis Cove, Estanque del Colegio Comunitario Mohave, Office Cove, Estanque de la Presa Parker, y el Lago Three Fingers. Dos de estas localidades (Estanque del bordo alto de Cibola y el Lago Three Fingers) están en peligro por la presencia de peces nonativos. Recientemente hemos documentado el desove y reclutamiento exitoso en Davis Cove y el Estanque de la Presa Parker. El intervalo de parámetros fisicoquímicos y biológicos variaron considerablemente entre localidades que albergan poblaciones en crecimiento o poblaciones estables de peces nativos. Conn, Jeff A1; Blasius, Heidi B2; Reinthal, Peter3 (1-Bureau of Land Management, Volunteer; 2-Bureau of Land Manage ment; 3-University of Arizona, Dept. Ecology and Evolutionary Biology) Yellow bullhead diet in Aravaipa Creek, Graham and Pinal counties, Arizona ABSTRACT Aravaipa Creek, in southeastern Arizona, is consider ed one of the premiere native fish streams in Arizona, supporting seven native fishes: roundtail chub, Gila robusta; speckled dace, Rhinichthys osculus; longfin dace, Agosia chrysogaster ; loach minnow, Tiaroga cobitis ; spikedace, Meda fulgida ; Sonora sucker, Catostomus insignis; and desert sucker, C. (Pantosteus) clarkii. In addition, three nonnative fish species (yellow bullhead, Ameiurus natalis , red shiner, Cyprinella lutrensis , green sunfish, Lepomis cyanellus ) also inhabit the mainstream and overlap with native fishes in the western (lower) end of Aravaipa Creek. Impacts of introduced red shiner and green sunfish on southwestern U.S.A. native faunas have been well documented in the literature. However, yellow bullhead impacts have not been documented and so remain uncertain. A diet study to investigate impacts of yellow bullhead on native fishes in Aravaipa Creek was conducted from March 2005 through December 2006. A total of 243 yellow bullhead were collected and examined. Fourteen had consumed fishes and one had consumed a lowland leopard frog, Rana yavapaiensis. Of fishes consumed, 33% (5/15) were loach minnow, 40% (6/15) were longfin dace, 6.7% (1/15) were desert sucker and Sonora sucker, and 13.3% (2/15) were unidentified suckers. The majority of yellow bullhead consumed primarily macroinvertebrates. [* Now placed in genus Lithobates – Eds.] RESUMEN Dieta del bagre torito amarillo en el Arr oyo Aravaipa, en los municipios de Graham y Pinal, Arizona En el sureste de Arizona, el Arroyo Aravaipa está considerado como uno de los primeros afluentes en peces nativos en Arizona, que contiene siete peces nativos: carpa cola redonda, Gila robusta ; carpita pinta, Rhinichthys osculus ; pupo panzaverde, Agosia chrysogaster ; carpita locha, Tiaroga cobitis ; carpita aguda, Meda fulgida ; matalote de Sonora, Catostomus insignis ; y matalote del desierto, C. (Pantosteus) clarkii . Además, tres peces no-nativ os (bagre torito amarillo, Ameiurus natalis, carpita roja, Cyprinella lutrensis, pez

sol, Lepomis cyanellus) también habitan en el afluente principal y se sobrelapan con los peces nativos en el extremo oeste (parte baja) del Arroyo Aravaipa. Los impactos sobre las faunas nativas por carpita roja y pez sol, introducidos en el suroeste de los Estados Unidos, están bien documentadas en la literatura. Sin embargo, los impactos del bagre torito amarillo no han sido documentados y por lo tanto son inciertos. Un estudio acerca de la dieta del bagre torito amarillo sobre peces nativos en el Arroyo Aravaipa se llevó a cabo de marzo 2005 a diciembre 2006. Se colectaron y examinaron un total de 243 bagres. Se encontró que catorce habían consumido peces y uno había consumido una rana leopardo de tierras bajas, Rana yavapaiensis *. De los peces consumidos, 33% (5/15) fueron carpita locha, 40% (6/15) pupo panzaverde, 6.7% (1/15) matalote del desierto y matalote de Sonora, y 13.3% (2/15) fueron matalotes no identificados. La mayoría de los ejemplares de bagre torito amarillo consumieron principalmente macroinvertebrados. [*Ahora colocada en el género Lithobates – Eds.] Conway, Carole A.*1; Fries, Joe N.2; Keeler-Foster, Connie1 (1-Dexter National Fish Hatchery & Technol ogy Center, U.S. Fish & Wildlife Service; 2-San Marcos National Fish Hatchery & Technology Center, U.S. Fish & Wildlife Service) Characterization of genetic structure and levels of variation in wild and captive populations of Devils River minnow ABSTRACT We conducted the first population genetic analysis of Devils River minnow, Dionda diaboli , to address elements of the Recovery Plan for the species. Our goals were to determine whether there was geographic variation in the genetic structure of the species, to as sess levels of variation, and to determine whether captivebred stocks were genetically repres entative of source populations. We used seven microsatellite markers to genotype 268 tissue samples from four sites in the Rio Grande basin, Texas, and two captive-bred stocks at San Marcos National Fish Hatchery and Technology Center. We found highly significant differences between samples from the Devils River and Pinto Creek, sites that have been separated by Amistad Dam and Reservoir since 1969. We found no significant differences among samples from different sites within the Devils River basin. The sample from Pinto Creek had a very low level of variation relative to samples from the Devils River. However, there were no indications that Pint o Creek experienced a population bottleneck or that the level of inbreeding was significant. We found that the captive-bred stocks were representative of the wild populations in terms of allele frequency distributions and levels of variation. RESUMEN Caracterización de la estructura genética y niveles de variación en poblaciones silvestres y cautivas de carpa diabla Se realizó el primer análisis gené tico poblacional de la carpa diabla, Dionda diaboli, para abordar algunos elementos del Plan de Recuperación para la especie. Nuestras metas fu eron determinar si había variación geográfica en la estructura genética de la especie, evaluar los niveles de variación, y determinar si las poblaciones criadas en cautiverio eran genéticamente representativas de las poblaciones fuente. Usamos siete marcadores microsatelitales para obtener el genotipo de 268 muestras de tejidos, de cuatro localidades en la cuenca del Río Bravo, Texas, y de dos poblaciones criadas en cautiverio en el Centro Nacional de Tecnología y Criadero de Peces San Marcos. Encontramos diferencias altamente significativas entre las muestras del Río Devils y el Arroyo Pinto, localidades que fueron separadas por la Presa Amistad y su reservorio desde 1969. No encontramos diferencias significativas entre las muestr as de diferentes sitios dentro de la cuenca del Río Devils. La muestra del Arroyo Pinto mostró un nivel mu y bajo de variación en relación a las muestras del Río Devils. Sin embargo, no hubo señales de que la población en el Arroyo Pinto haya experimentado un cuello de botella o que el nivel de endogamia fuera significante. Encontramos que las poblaciones criadas en cautiverio son representativas de las poblaciones silvestres en términos de la distribución de frecuencia de alelos y los niveles de variación.

Davenport, Stephen R. 1; Brooks, James E. *1; Remshardt, William J. 1; Coleman, Stephanie M. 1; Propst, David L. 2; Zymonas, Nik D. 2; Platania, Steven P.3; Brandenburg, William H.3 (1-U.S. Fish and Wildlife Service, New Mexi co Fishery Resources Office; 2-New Mexico Department of Game and Fish, Conservation Services Division; 3-American Southwestern Ichthyological Researchers) Native fish conservation, research and management in the upper/middle Rio Grande basin, New Mexico, 2006/2007 (Area Report) ABSTRACT U. S. Forest Service (USFS), New Mexico Department of Game and Fish (NMDGF) and U.S. Fish and Wildlife Service (USFWS) surveyed Gila trout ( Oncorhynchus gilae) populations in four streams, and carried out two piscicide applications on the West Fork of the Gila River. Gila trout were stocked into Black Canyon and brood stock was collected from South Diamond and relocated to Mora National Fish Hatchery and Technology Center. American Southwestern Icthyolo gical Researchers (ASIR) continued Rio Grande silvery minnow (Hybognathus amarus) monitoring in 2006 and conducted spawning studies. Salvage of this species from dry river sections by USFWS continued, as did augmentation of the wild population, and captive propagation at Dexter National Fish Hatchery and Technology Center and Albuquerque Biological Park. Twenty miles of Comanche Creek were treated with piscicide following extensive mechanical removal of non-natives. This treatment is part of a restoration of the Rio Costilla watershed. The project aims to eventually reestablish Rio Grande cutthroat trout ( Oncorhynchus clarkii virginalis ), Rio Grande sucker ( Catostomus plebeius) and Rio Grande chub (Gila pandora) to the watershed. University of New Mexico (UNM) carried out genetic research on Rio Grande silvery minnow and Rio Grande cutthroat tr out. Water appropriations maintained surface flows on the Pecos River. Pecos bluntnose shiner (Notropis simus pecosensis) population trends are tracked through a long-term monitoring effort. Research at UNM established baseline genetics for Pecos bluntnose shiner. A river restoration project by USFWS at Bitter Lake Na tional Wildlife Refuge will reconnect oxbows to river flow, remove salt cedar and reconnect river to flood plain. Bigscale logperch ( Percina macrolepida ) and greenthroat darter (Etheostoma lepidum) monitoring is scheduled to begin by USFWS during 2007. Surveys by NMDGF in lower Pecos River found gray redhorse ( Moxostoma congestum, Catostomidae) locally common, but blue sucker (Cycleptus elongatus) rare, and a larval series of gray redhorse was developed. A fish community monitoring effort by ASIR and NMDGF on the Canadian River of New Mexico continued. Sampling is focused on providing status information for four protected taxa: suckermouth minnow (Phenacobius mirabilis ), southern redbelly dace ( Phoxinus erythrogaster ), Arkansas River speckled chub (Macrhybopsis aestivalis tetranemus ) and Arkansas River shiner ( Notropis girardi ). In the Tularosa basin, yearly monitoring of White Sands pupfish ( Cyprinodon tularosa) continued into year twelve, and the status of the fish is stable. San Juan River fishery work continued with expansion of non-natives removal by USFWS and partners. Release of Colorado pikeminnow (Ptychocheilus lucius) and razorback sucker (Xyrauchen texanus) continued, and USFWS began experimental soft-release techniques of Colorado pikeminnow. Razorback sucker larval surveys by ASIR continued during 2006/07, as did monitoring of small-bodied fishes by NMDGF. RESUMEN Informe de Área: Conservación de peces nativos, investigación y manejo en la parte alta y media de la cuenca del Río Bravo (Rio Grande), Nuevo México, 2006/2007 El Sevicio Forestal de los Estados Unidos (USFS por su acrónimo en inglés), el Departamento de Caza y Pesca de Nuevo México (NMDGF por su acrónimo en inglés) y el Servicio de Pesca y Vida Silvestre de los Estados Unidos (USFWS por su acrónimo en inglés) estudiaron las poblaciones de la trucha del Gila (Oncorhynchus gilae) en cuatro afluentes, y efectuaron dos aplicaciones de piscicidas en el ramal Oeste del Río Gila. La trucha del Gila fue sembrada en el Cañón Black y unos individuos para fines de propagación en criadero fueron colectados de South Diamond y reubicad a en el Centro Nacional de Tecnología y Criadero de Peces Mora. Los Investigadores de Ictiología del Suroeste Americano (ASIR por su acrónimo en inglés) continuaron el monitoreo en 2006 de la carpa Chamizal ( Hybognathus amarus ) y realizaron estudios de desove. El salvamento por parte del USFWS de esta especie de secciones secas del Río Bravo (Rio Grande en Nuevo México) continuaron, así como el aumento de la población silvestre y propagación en cautiverio en el Centro

de Tecnología y Criadero de Peces Dexter y el Par que Biológico Albuquerque. Veinte millas del Arroyo Comanche fueron tratadas con piscicidas, después de una cuantiosa remoción mecán ica de peces no-nativos. Este tratamiento es parte de la restauración de la cuenca del Río Costilla. El proyecto pretende reestablecer eventualmente a la trucha degollada del Bravo ( Oncorhynchus clarkii virginalis ), matalote del Bravo (Catostomus plebeius) y carpa del Bravo ( Gila pandora) en dicha cuenca. La Univ ersidad de Nuevo México (UNM) realizó una investigación de genética para la car pa Chamizal y la trucha degollada del Bravo. Las apropriaciones de agua mantuvieron los flujos de agua superficiales en el Río Pecos. Se le da seguimiento a la tendencia de la población de carpita chata del Pecos ( Notropis simus pecosensis ) a través de un esfuerzo de monitoreo a largo plazo. Una investigación en la UNM determinó la genética básica para la carpita chata del Pecos. Un proyecto de restauración de río conducido por USFWS en el Refugio Nacional de Vida Silvestre del Lago Bitter reconectará canales semicirculares aislados al flujo del río, removerá el pino salado y reconectará el río a la planicie de inundación. Un monitoreo de perca escamona ( Percina macrolepida) y perca garganta verde (Etheostoma lepidum) está programado para ser iniciado por el USFWS en 2007. Las prospecciones por el NMDGF en la parte baja del Río Pecos registrar on localmente común a la especie de matalote gris (Moxostoma congestum , Catostomidae), pero también registraron como raro al matalote azul ( Cycleptus elongatus), y se desarrolló una serie de las etapas larvarias para matalote gris. Se continuó con el esfuerzo de monitoreo para la comunidad de peces por ASIR y el NMDGF en el Río Canadian de Nuevo México. Dicho muestreo está enfocado a obtener información del estado actual de cuatro taxa protegidas: carpita chupadora ( Phenacobius mirabilis ), carpita panzarroja sureña ( Phoxinus erythrogaster), carpa pecosa del Arkansas ( Macrhybopsis aestivalis tetranemus ) y carpita del Arkansas (Notropis girardi ). En la cuenca de Tularosa, se está ya en el año doceavo de monitoreo anual para el cachorrito de White Sands (Cyprinodon tularosa) y el estatus para este pez se reporta como estable. El trabajo en el Río San Juan continuó con la expansión de acciones para eliminación de peces no-nativos por el USFWS y asociados. La liberación de carpa gigante del Colorado ( Ptychocheilus lucius) y el matalote jorobado ( Xyrauchen texanus ) continúan, y el USFWS inició trabaj os con técnicas experimentales para liberación-suave de la carpa gigante del Colorado. La s prospecciones de larvas de matalote jorobado continúaron realizándose por ASIR durante 2006/07, así como el monitoreo de peces pequeños por el NMDGF.