Temporal genetic variation and effective population size in Rio Grande silvery minnow, Hybognathus amarus: a preliminary evaluation

Authors: Turner, TF, Alo, D

Year: 2000 (xxxii)

Abstract

We studied temporal genetic variation at a panel of nuclear DNA microsate llite loci of the endangered Rio Grande silvery minnow. Samples were taken at a single location over two generations (1999-2000) to estimate levels of genetic diversity in the species, and to evaluate temporal changes in genetic diversity. Preliminary analysis indicated a higher frequency of heterozygotes than expected under Hardy-Weinberg equilibrium for three of five loci studied. Short-term heterozygote excess is expected when a population has undergone recent and dramatic declines in abundance. Temporal shifts in genetic diversity were used to estimate the current (variance) effective population size, but accuracy of these estimates may be compromised by small sample sizes (ca. 50 individuals per year class).

Resumen

Variación genética temporal y el tamaño efectivo de población de la carpa Chamizal, Hybognathus amarus: una evaluación preliminar Se investigó la variabilidad genética temporal en un panel de loci microsatelitales de ADN nuclear de la carpa Chamizal, especie en peligro de extinción. Se tomaron muestras en un sólo sitio durante dos generaciones (1999-2000) para evaluar la diversidad genética de la especie y sus cambios temporales. Los resultados preliminares indican una mayor frecuencia de heterocigotos que la esperada bajo equilibrio Hardy-Weinberg en los tres loci considerados. Cuando una población ha experimentado un reciente descenso dramático de abundancia se esperaría encontrar un exceso de heterocigotos a corto plazo. Con base en los cambios temporales de diversidad genética se estimó el tamaño efectivo actual (varianza), aunque la estimación pudo haber sido afectada por el pequeño tamaño de las muestras (alrededor de 50 organismos por clase anual).