VARIABILIDAD GENÁ‰TICA DEL BAGRE YAQUI, (ICTALURUS PRICEI (PISCES: ICTALURIDAE) EN LA CUENCA DEL RÁO YAQUI, SONORA Y CHIHUAHUA/Genetic variability of the Yaqui catfish( Ictalurus pricei (Pisces: Ictaluradae) in the Yaqui River basin, Sonora and Chihuahua
Authors: María Irais Trujillo-Villalba, Alejandro Varela-Romero
Year: 2010 (xlii)
Abstract
Ictalurus is the unique native genus of ictalurid in north, and central Mexico. It includes listed species for protection by the Mexican government, as well as represents economic potential because it includes commercial fishery and aquacultural species. The Yaqui catfish (Ictalurus pricei) is the native species recorded to Yaqui, Sonora, and Mayo, Fuerte, and Casas Grande basins in Northwest Mexico. Actually, it only occurs in the Yaqui and Fuerte rivers. Official conservation status is under special protection. Because of the impact of the introduction of exotic catfishes (I. punctatus, I. furcatus) which occurs in its natural habitats, and records of hybridization with the first mentioned exists, the status is proposed to change to endangered. Beyond actual and potential threats over the Yaqui catfish by the use of congeneric catfishes for aquaculture, the knowledge of genetic population structure is required for the conservation of this national native genome. This work will evaluate the genetic variability between Bavispe and Aros-Papigochic-Sirupa (Tutuaca) subbasins in the Yaqui basin to know the population genetic structure for conservation and potential uses in aquaculture. The genetic variability will be estimated by PCR-RFLP and analysis of the nucleotidic sequences of the control region (CR) of the mitochondrial DNA in the Bavispe and Tutuaca subbasin in Sonora and Chihuahua. From 33 specimens collected in the Tutuaca river, and 11 of the Bavispe, fin clips were obtained for DNA amplifications by specific primers. For PCF-RFLP, 9 restriction endonucleases were used, and each PCR product was sequenced for the analysis of the variation. To process the genetic variation the software Arlequin, PHYLIP and PAUP will be used. Genetic variation will be estimated by nucleon diversity, homogeneity of genetic frequencies, haplotype diversity, nucleotide diversity, net nucleotide sequences divergence, and differentiation between populations (Gst). At this time, the complete sequence of the CR has been obtained from 33 samples of the Tutuaca river, and only 5 from the Bavispe river.
Ictalurus es el único género nativo de ictalúrido para el norte y centro de México, además de incluir especies enlistadas para su protección por el gobierno Mexicano y presenta potencial económico por tratarse de especies con importancia comercial, pesquera y acuícola. El bagre Yaqui (Ictalurus pricei) es la especie nativa para las cuencas de los ríos Yaqui, Sonora, Mayo, Fuerte y Casas Grandes en los estados de Sonora, Chihuahua y Sinaloa en el Noroeste de México. Actualmente sólo habita las cuencas de los ríos Yaqui y Fuerte. Su estatus de conservación oficial en México es sujeto a protección especial. Debido al impacto por la introducción de bagres exóticos (I. punctatus, I. furcatus) que ocupan sus hábitats naturales y del primero se han registrado eventos de hibridación se ha propuesto cambiar su estatus a en peligro de extinción. Dadas las amenazas actuales sobre el bagre Yaqui y las potenciales por el uso de bagres congéneres exóticos para acuicultura, urge conocer la estructura genética poblacional de este representante del germoplasma nacional. Este trabajo evaluará su variabilidad genética en las subcuencas de los ríos Bavíspe y Aros-Papigochic-Sirupa (Tutuaca) en la cuenca del río Yaqui para conocer la estructura genética poblacional con fines de conservación y utilización acuícola potencial. La variabilidad genética se estimará por PCR-RFLP y análisis de las secuencias nucleotídicas de la región control (RC) del DNA mitocondrial de las subcuencas de los ríos Bavíspe en Sonora y Tutuaca en Chihuahua. De los 33 especimenes recolectados en la subcuenca del río Tutuaca y 11 del Bavíspe se tomó tejido de aleta pélvica y se extrajo el DNA para la amplificaron de la RC utilizando cebadores específicos. Para su análisis por PCR-RFLP se utilizaron 9 endonucleas de restricción y se secuenció cada producto de PCR para el análisis de su variación. Para el procesamiento de la información se utilizarán Arlequín, PHYLIP y PAUP. La variabilidad genética se calculará por la estimación de la diversidad de nucleón y la diversidad de nucleótido, por el número de sustituciones netas de nucleótidos, la homogeneidad de las frecuencias de haplotipos, el porcentaje de divergencia de secuencias entre haplotipos y el análisis Gst entre muestras. Hasta el momento se logró obtener la región control completa de las 33 muestras pertenecientes al Río Tutuaca y de 5 de las 11 muestras del río Bavíspe.
Resumen
Ictalurus es el único género nativo de ictalúrido para el norte y centro de México, además de incluir especies enlistadas para su protección por el gobierno Mexicano y presenta potencial económico por tratarse de especies con importancia comercial, pesquera y acuícola. El bagre Yaqui (Ictalurus pricei) es la especie nativa para las cuencas de los ríos Yaqui, Sonora, Mayo, Fuerte y Casas Grandes en los estados de Sonora, Chihuahua y Sinaloa en el Noroeste de México. Actualmente sólo habita las cuencas de los ríos Yaqui y Fuerte. Su estatus de conservación oficial en México es sujeto a protección especial. Debido al impacto por la introducción de bagres exóticos (I. punctatus, I. furcatus) que ocupan sus hábitats naturales y del primero se han registrado eventos de hibridación se ha propuesto cambiar su estatus a en peligro de extinción. Dadas las amenazas actuales sobre el bagre Yaqui y las potenciales por el uso de bagres congéneres exóticos para acuicultura, urge conocer la estructura genética poblacional de este representante del germoplasma nacional. Este trabajo evaluará su variabilidad genética en las subcuencas de los ríos Bavíspe y Aros-Papigochic-Sirupa (Tutuaca) en la cuenca del río Yaqui para conocer la estructura genética poblacional con fines de conservación y utilización acuícola potencial. La variabilidad genética se estimará por PCR-RFLP y análisis de las secuencias nucleotídicas de la región control (RC) del DNA mitocondrial de las subcuencas de los ríos Bavíspe en Sonora y Tutuaca en Chihuahua. De los 33 especimenes recolectados en la subcuenca del río Tutuaca y 11 del Bavíspe se tomó tejido de aleta pélvica y se extrajo el DNA para la amplificaron de la RC utilizando cebadores específicos. Para su análisis por PCR-RFLP se utilizaron 9 endonucleas de restricción y se secuenció cada producto de PCR para el análisis de su variación. Para el procesamiento de la información se utilizarán Arlequín, PHYLIP y PAUP. La variabilidad genética se calculará por la estimación de la diversidad de nucleón y la diversidad de nucleótido, por el número de sustituciones netas de nucleótidos, la homogeneidad de las frecuencias de haplotipos, el porcentaje de divergencia de secuencias entre haplotipos y el análisis Gst entre muestras. Hasta el momento se logró obtener la región control completa de las 33 muestras pertenecientes al Río Tutuaca y de 5 de las 11 muestras del río Bavíspe.