Fifty years of Desert Fishes Council Proceedings as a resource for retrieving otherwise lost knowledge and control of shifting baselines

Authors: Dean Hendrickson, Gary Garrett, Lloyd T. Findley, Edwin P. Pister

Year: 2018

Abstract

All volumes of the Desert Fishes Council Proceedings have been available online for many years, but as a large collection of single-year separate files in diverse formats, making exploration of the total content inefficient. Recognizing the considerable potential value of the now 50 years of knowledge relevant to the DFC mission, we have made at least some progress toward making all of the Proceedings content more readily accessible and useful and report on that here. Prior to 1992, the content of all volumes is in graphic-based PDF files (usually one file for each year), so their text is not searchable by computers. All abstracts from 2008 - 2017 have been searchable in a partially normalized database made available online as a Google Fusion Table so relatively rigorous online searching and summarization of that content is facilitated. The 1992-2007 content originated in digital format starting with abstract submission by authors on 5 1/2 inch floppy disks sent via Post (and later via email) to the editor. However, formatting of the published content varied over those years, and it was edited in text processors, not in the database, so final content is now available only in the format of the PDFs used for printing each volume. Significant manual work by humans would still be required to extract all content into a single, fully normalized database, but on the occasion of the 50th anniversary of the Council, the first author applied automated Optical Character Recognition to all pre-1992 graphics-based content, and then concatenated all Proceedings volumes and all abstracts from 1969-2017 into a single, massive (152 mb) text-based, downloadable and searchable PDF file now permanently archived on the web: Hendrickson, Dean A., Edwin P. Pister, Lloyd T. Findley, and Gary P. Garrett. 2018. Compiled Proceedings of the Desert Fishes Council. Volume 1 (1969–2017): 4057 pages. https://doi.org/10.15781/T2QB9VR0N. Though work should continue toward getting all DFC Proceedings content extracted, fully normalized into a single, easily analyzed database accessible to both computers and humans, we here report on our own applications of this now somewhat more accessible knowledgebase. This new fully text-based format clearly has the potential to help counter shifting conservation baselines by easily exposing often forgotten or simply overlooked, previously gray or dark biodiversity data. We welcome input from users of this resource before we add all content from the 2018 meeting to produce and publish version 2 of this file. Todos los volúmenes de los Procedimientos del Consejo de Desert Fishes han estado disponibles en línea durante muchos años, pero como una gran colección de archivos separados de un solo año en diversos formatos, hacen que la exploración del contenido total sea ineficiente. Reconociendo el considerable valor potencial de los ahora 50 años de conocimiento relevantes para la misión de DFC, hemos logrado al menos algún progreso para hacer que todo el contenido de los Procedimientos sea más accesible y útil, e informamos sobre esto aquí. Antes de 1992, el contenido de todos los volúmenes está en archivos PDF basados ??en gráficos (generalmente un archivo por cada año), por lo que su computadora no puede buscar su texto. Todos los resúmenes de 2008 a 2017 se pueden buscar en una base de datos parcialmente normalizada que se encuentra disponible en línea como una tabla de Google Fusion, por lo que se facilita la búsqueda en línea relativamente relativamente rigurosa y el resumen de ese contenido. El contenido de 1992-2007 se originó en formato digital a partir del envío de resúmenes por parte de los autores en disquetes de 5 1/2 pulgadas enviados por correo postal (y posteriormente por correo electrónico) al editor. Sin embargo, el formato del contenido publicado varió a lo largo de esos años, y se editó en procesadores de texto, no en la base de datos, por lo que el contenido final ahora está disponible solo en el formato de los PDF utilizados para imprimir cada volumen. Aún se requeriría un importante trabajo manual por parte de los seres humanos para extraer todo el contenido en una base de datos única y completamente normalizada, pero con motivo del 50 aniversario del Consejo, el primer autor aplicó el Reconocimiento óptico de caracteres a todo el contenido gráfico anterior a 1992. , y luego concatenó todos los volúmenes de Proceedings y todos los resúmenes de 1969-2017 en un único archivo PDF masivo (152 mb) basado en texto, descargable y con capacidad de búsqueda ahora archivado de forma permanente en la web: Hendrickson, Dean A., Edwin P. Pister, Lloyd T. Findley y Gary P. Garrett. 2018. “Actas compiladas del Consejo de peces del desierto” Volumen 1 (1969–2017): 4057 páginas. https://doi.org/10.15781/T2QB9VR0N. Aunque el trabajo debe continuar para obtener todo el contenido de los Procedimientos de DFC extraídos, completamente normalizados en una base de datos única y fácilmente analizable a la que puedan acceder tanto las computadoras como los humanos, aquí informamos sobre nuestras propias aplicaciones de esta base de conocimientos ahora algo más accesible. Este nuevo formato totalmente basado en texto tiene claramente el potencial de ayudar a contrarrestar los cambios en las líneas de base de la conservación al exponer fácilmente los datos de biodiversidad olvidados o simplemente pasados por alto, previamente “grises” u “oscuros”. Agradecemos los comentarios de los usuarios de este recurso antes de agregar todo el contenido de la reunión de 2018 para producir y publicar la versión 2 de este archivo.