The use of Polymerase Chain Reaction for the identification of catostomid fishes in the Green River system / El uso de la técnica de reacción en cadena de la polimerasa para la identificación de peces Catostómidos en el Sistema Green River

KEYWORDS: Green River; Catostomidae; Catostomus discobolus; Catostomus latipinnis; Xyrauchen texanus; DNA analysis; Polymerase Chain Reaction

ABSTRACT

The identification of larval catostomids has been a significant problem for researchers studying the native fishes of the Green River. Often larval fish collected in the field have not yet developed diagnostic morphological characters and their identification requires that they be reared to a larger size. Mortalities, both from collecting and during rearing, can be high and rearing also delays progress on studies. Any tool that would speed species identifications would be beneficial to the study and management of the native fishes.

We used the polymerase chain reaction (PCR) to amplify a portion of the mitochondrial genome from suckers native to the Colorado system. The PCR product was cut with restriction enzymes and the resulting fragment patterns were compared. Total DNA was extracted from sucker tissues obtained in the late 1980's and archived at BYU. The suckers were originally collected from Cottonwood Creek, Utah, a Green River tributary and the Razorback sucker tissue was provided by the Dexter National Fish Hatchery. DNA was also extracted from tissues taken from larval razorback sucker mortalities at the experimental hatchery operated by the U.S. Fish and Wildlife Service at the Ouray National Wildlife Refuge, Utah. Differences in restriction patterns were found, and while further investigation of the overall variability in the patterns within species are necessary, these preliminary results do show promise.

RESUMEN

La identificación de larvas de catostómidos ha sido un problema fundamental para los investigadores que han estudiado los peces nativos de Green River. Frecuentemente las larvas de peces colectadas en el campo aún no han desarrollado características morfológicas diagnósticas; y su identificación requiere que éstas sean cultivadas hasta que alcancen un tamaño mayor. La mortalidad larval puede ser alta tanto en la colecta como durante el cultivo; asimismo el cultivo puede también retardar los avances sobre su estudio. Cualquier procedimiento que pudiera agilizar el proceso de identificación de las especies sería de gran utilidad para el estudio y manejo de los peces nativos.

En el presente estudio, se utilizó la técnica de reacción en cadena de la polimerasa (PCR) para amplificar una porción del genoma mitocondrial de peces catostómidos nativos del sistema Colorado. El producto de PCR fue cortado con enzimas de restricción y los patrones de los fragmentos resultantes fueron comparados. El ADN total fue extraído de los tejidos de peces catostómidos colectados a finales de 1980 y preservados en Brigham Young University. Los catostómidos fueron originalmente colectados en Cottonwood Creek, Utah, un arroyo tributario de Green River, y los tejidos del matalote jorobado fueron proporcionados por la piscifactoría Dexter National Fish Hatchery. El ADN también fue extraído de tejidos tomados de larvas muertas del matalote jorobado en la piscifactoría experimental operada por U.S. Fish and Wildlife Service en el Refugio Nacional de Vida Silvestre de Ouray, Utah. Se encontraron diferencias en los patrones de restricción, sin embargo es necesario un mayor número de estudios para determinar la variabilidad total en los patrones dentro de las especies. Los resultados preliminares aquí obtenidos son considerados como prometedores.

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